蝙蝠有种香气腺会产生强烈浓郁的麝香气味，它们栖息的地方常有这种气味，虽然只是一点点，很远的地方也闻得到。这种气味，可能用来帮助蝙蝠找到原来的洞穴，也可能用来吸引同类的蝙蝠来结合成一个群体。科特（1926年）曾发现在亚马孙河河口附近的马拉乔岛上的中空树干内，有数种蝙蝠的群体一起生活。他写道：“树干内有特别浓郁和可厌的气味。它们的巢穴所在地，往往可由此气味来确认。当它们停歇于公墓上的时候，我可以从它们所栖息的树丛90多米远的距离，觉察出这种气味。”
蝙蝠身上香气腺的位置各不相同，如大棕蝙蝠是在沿着上唇的膨胀部分，家蝠则在喉头上端的中间部分有圆形小瘤状腺体。另外有些蝙蝠在头部前面的中央有很大的腺体，有些在喉头下端的中央具有大袋状的腺体。除了在头部和喉头之外，少数蝙蝠在飞膜上有香气腺。有一种家蝠的雄性个体，在尾部的基底有一小片腺毛，在飞膜内有香气腺的存在。
南美的袋翅蝙蝠的飞膜内有很大的袋状腺，从肩部的前端延伸到腕部。其中有一种蝙蝠，它的腺体开孔靠近飞膜上侧的肘部和前臂区域，可由肌肉的动作而扩张，但此开口通常是紧密而皱缩的合在一起。开口的内侧是浅白的颜色，和黑色的飞膜互相对映。米勒在食鱼性蝙蝠中，发现有一奇特腺体位于前臂和翅膀的第五指之间的飞膜内，大小有如燕麦。它在三只雌蝙蝠身上发育良好，雄蝙蝠却缺少此一腺体。一般雄蝙蝠的香气腺都比雌蝙蝠大，有的雌蝙蝠根本没有香气腺。
繁殖时期是香气腺的活动期，它们的气味可用来吸引或刺激异性。除了寻找原来栖息的洞穴，香气还可用来赶走敌人，使敌人厌恶而撤离。香气腺的存在，表示蝙蝠有发育良好的嗅觉器官，食果性蝙蝠便可凭嗅觉找寻食物。南美的热带地区中，如果在屋子内挂一堆成熟的香蕉，很快就会引来许多蝙蝠。食花性蝙蝠也会被某种强烈的花香所吸引。
当我们手中握着一只蝙蝠时，应该如何来安置它呢？手中握一只蝙蝠就像握住一团烧热的煤球一样，把它放开似乎是最好的办法。握住任何一只受惊的蝙蝠都会有被咬的危险。因此，我们如果不想把它放掉，就必须要改变另一种方法来握持它。P24-25
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