本书将从历史实践出发回溯中国科学的近代史，通过溯本清流对近代科学在中国的本土化实践做出再解释。这里，“再解释”意味着，本书的解释并非仅仅建立在历史事实之上，它还要面对此前已经存在的各种各样的解释。在导论部分，我们将首先提出本研究的主要背景，对既有的研究文献做一个大致的梳理，并交代我们的研究主题和研究方法。
近代科学在中国的本土实践，经历了艰难曲折的发展过程。从自然科学到社会科学，从器物、技术到思想，从翻译会通到社会建构，从徐光启到魏源、严复，从张之洞、曾国藩、李鸿章到康有为、梁启超再到蔡元培、陈独秀、胡适，历史向我们展示了一幅壮丽的画卷。本书作者指出：将近代科学引入中国并完成其在我国的体制化，只能说是本土实践的一个基本阶段；中国人只有将自主创新获得的科学成果回馈并推进世界科技世界，才算是达到了相对于前者而言更为高级的阶段。
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