故事发生在纽约大都会里，由让·雷诺所饰演的职业杀手里昂，受餐厅老板委托杀人。当他是以杀手的身份出现时，冷静而神秘，杀人手法令人热血沸腾。但当他卸下杀手面具时，则又回归成为平凡的市井小民，简单到连基本身份证、银行帐号都没有，每天至少喝杯鲜奶，喜欢浇花及细心地擦拭心爱盆栽的树叶，是个具有双重身份角色扮演的人。而就在里昂所住的公寓内，有人暗渡陈仓的进行毒品交易，小女孩马蒂达的父亲是警方缉毒组的线人，因为贪心，私吞了部分毒品，遭到神经质警官斯坦报复，杀了全家人却遗漏了小女孩马蒂达。马蒂达为了安全起见而躲进隔壁里昂家，她知道了里昂的杀手身份，为了保护自己及报杀弟之仇，马蒂达以坚定的口气要求里昂训练她成为一位真正的职业杀手。在此之后，斯坦亦全力搜寻马蒂达以杀人灭口，里昂只身闯入警局解救去复仇的马蒂达，并杀死了警员。警方大惊之余，下令围剿公寓楼并全力搜捕里昂，双方交战之下引发了一场紧张刺激的终极追杀。
里昂撂倒一片警察，再次救出女孩并让她通过通风管道逃生，并嘱咐她他留给她的钱在餐厅老板那里。里昂化装成警察想混出包围圈，但被斯坦识破。最后一刻，里昂引爆了身上的炸弹。
里昂已经40岁了，他是一名习惯独来独往的职业杀手，并且始终恪守着不杀女人和孩子的原则；而玛蒂达却只是一个普通的12岁的邻家女孩。这样的两个人的生活轨迹本互不相干，原来也不会有任何交集，然而只因后者不幸惨遭灭门之祸才令二人意外的走到了一起，并且在他们之间还产生了一种奇妙的化学反应：爱情。
这乍看起来有些匪夷所思，毕竟两人的年纪相差太大，但细细一想，却又在情理之中。
里昂虽然已年届中年，而且为人沉默冷酷、机智干练，但在他不苟言笑的外表下，却深藏着一颗温柔善良、天真质朴的赤子之心，多年来离群索居的杀手生活令他倍感孤独与寂寞，生活中唯一的亮色就是那盆银皇后。他把它当成自己的生命一样来培育，不知不觉，这盆绿色植物成了他生活中唯一的朋友——在他眼中，它甚至就是另一个自己。而女孩玛蒂达虽然年纪尚小，且看起来是那般的柔弱无依、楚楚可怜，但她的生活经历以及悲惨的特殊遭遇令她的性格变的非常的倔强任性、独立自主，而且还有着与年龄极不相称的成熟。里昂对于她而言，固然是值得信赖与依靠的对象，而她对于里昂而言，又何尝不是后者黑色生命中那缕突然出现的金色阳光呢？同是天涯沦落人，再加上长时间的相濡与沫，生死与共，于是这样两个有着同样孤独且渴望温暖的灵魂自然越走越近，最终擦出微妙的火花。
虽然里昂最后为了救玛蒂达而牺牲了自己的性命，但他一定不会后悔爱上她。因为是她，让他重温了生活的乐趣，感受到了爱情的甜美，并且完成了对自身灵魂的救赎(他最终用自己的血，洗清自己曾犯下的罪孽)；而玛蒂达呢，相信亦不会后悔把自己的初恋给了那个叫里昂的中年男人，因为是他，让她得到保护不受伤害，重温久违的家庭的温暖，并明白了爱情的真谛，且学会了该如何去珍惜。
