该剧故事根据清郭小亭著《济公全传》以及民间故事改编，传说前世为降龙尊者的济公降生到善人李茂春家中，取名李修缘，后投身灵隐寺，自号“济癫”。在灵隐寺，“济癫”不限佛门清规戒律，行为“异常”实心存大善，除恶扬善，被百姓称为“圣僧”、“活佛”。而与降龙罗汉素有过节的大鹏，逃离仙界后带领弟子狐狸白灵、黑风对济公进行报复。济公运用自己智慧，与以大鹏为代表的丑恶势力和现象斗智、斗勇，拯救百姓于苦难，其传奇故事被世世代代广为传颂。该据制片人王世伟介绍 ，《活佛济公》计划拍摄120集，这次拍济公是从济公年轻时拍起，“他是一个人间佛，普渡众生，但也有自己的烦恼，比如他在新婚之夜悟道出家，对妻子一直有愧疚。第一部40集里讲述了《血珍珠》、《挖心》、《怀孕郎》、《天雷报》、《古井运木》、《胭脂泪》等8个故事，目前已经敲定8月暑期档播出。”
《血珍珠》小灵子原来是圣德乃文殊菩萨坐骑灵狮玩耍之物，名“火灵珠”，当年贪玩下凡结识蚌精并暗生情愫，因蚌精无法逃脱雷劫，火灵珠牺牲内丹救活蚌精，魂飞魄散的火灵珠却误入魔道，被乾坤洞主收为弟子，成为大鹏的师弟。静光寺门外，圣德发现明珠就是自己苦苦寻找已久的前世恋人小珍珠。当明珠知道是圣德救了自己的真相时，明珠哑然，一直以来她都认定是张天元的前世救活自己，为了报恩才下嫁于天元，谁知命运却开了个大玩笑。圣德要明珠回到他的身边，明珠拒绝并称自己已经爱上了天元。明珠恳求圣德放过天元，圣德却对明珠拒绝自己而且爱上凡人恼羞成怒。圣德用法力收回明珠体内的血丹，明珠宁可一死也不愿背叛天元。济公赶到，救出失去内丹现出原形的明珠，却不敌血丹发出的红光，就在济公将要抵挡不住之时，圣德却突然收手，赶回静光寺。济公带着明珠的原形——一只大河蚌来到张家，称将河蚌送给张奶奶，张奶奶见这难得一见大河蚌颇有灵性，心下甚喜。白灵亦带着天元回到张家，得知张奶奶得到一个大河蚌，认定那是明珠所变。白灵有意告诉天元，大河蚌体内有颗“血珍珠”是稀世珍宝。天元为了讨好白灵准备取出血珍珠，他用柴刀撬开河蚌，刀尖刺进明珠的身体，弄得天元满身是血，明珠性命垂危。白灵得知天元撬开大河蚌惊讶不已，张奶奶更是责怪天元不该将这有灵性的大河蚌杀了，张奶奶赶到柴房却发现明珠倒在血泊中。明珠临死前将自己是蚌精的身份如实说出，更告诉奶奶和天元，自己是用鲜血来养蚌，生产粉红珍珠。奶奶终于明白了明珠的苦衷，直呼明珠为自己的好孙媳妇，天元却称自己不要妖怪做妻子，他要去找白灵并娶她为妻。济公手执佛像出现，佛像放出光芒，明珠的魂魄飞出，济公带着明珠的魂魄离去，奶奶悲痛万分。圣德得知天元杀了明珠又惊又怒，欲杀天元为明珠偿命，此时明珠的魂魄出现，劝说圣德不可再杀生，文殊菩萨现身将圣德回归成“火灵珠”，明珠之魂亦跟着菩萨西去，历经劫难后终成正果。
