《清源文献》编成于万历二十五年丁酉（1597），为清源一地历代诗文之合集，包括赋、诗、调、偈颂、制、敕、诰、册文、表、露布、奏疏、状、颂、赞、箴、铭、文、拟、原、戒、论、议、评、说、篇、述、问、对、辨、解、读、疑、题、跋、杂著、书、启、序、记、碑、传、行状、祭文、哀辞、墓志铭、圹志、神道碑、墓表、墓碣等数十种文体。卷首列爵里一卷，主要是按类条列所收诗文集的作者，大体上分为寓贤、溯贤、孕贤、郡贤、爵里疑误、布衣、闺秀、释子、女冠、羽士等十类。凡侨寓于泉者列入寓贤一类，收录了自唐代秦系至元代王翰十二人。二为溯贤，即追溯未迁至清源的父祖辈人物，收录了宋代李昭□、傅尧俞二人。三为孕贤，即诞生于清源及及其父祖为泉人者，收录了宋代王曾、韩琦和明邱？三人。四为郡贤，又细分为荐绅、藩王和武弁，其中荐绅类则收录了唐代欧阳詹至明代周训二百五人，藩王类收录了宋代陈洪进一人，武弁类则收录了明代俞大猷、邓城二人。五为爵里疑误类，收录了宋代段全等五人。六为布衣类，收录了唐代王毂等二十六人。七为闺秀类，收录了宋代陈夫人等三人。八为释子类，收录了唐代释智亮等十五人。九为女冠类，收录了尼无著等六人。很后为羽士类，收录了谭峭等二人。凡诗、赋、杂文，悉加甄录，采辑颇广。但也有收录不当之处，如王曾、邱？皆终身未至清源而却加以收录，未免失于限断。
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