该书分为十一部分。部分是伏邪概论，介绍了伏邪的特征、伏邪分类、伏邪病种、伏邪以及学习伏邪学说的意义。第二部分是伏邪病机，分别讲述了感而不发、邪伏不争、少阴虚寒、厥阴入络、伏邪成巢、伏邪成劳这六个基本病机。第三部分是伏邪诊断，从伏邪脉法、伏邪的特殊症状等方面，介绍了伏邪的诊断方法。第四部分是伏邪治法，讲述了伏邪的五个基本原则等。第五部分是伏邪用药，讲述了伏邪常用的特殊等。第六部分是伏邪用方，讲述了伏邪的主方等方剂的制方及临床应用。第七部分是伏邪验方，讲述了吴门伏邪验方的制方原理及临床主治等。第八部分是自身免疫病的，讲述了自身免疫病的特征、如何从伏邪看自身免疫病，以及用伏邪理论指导干燥综合征、荨麻疹、强直性脊柱炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、性口疮、白塞氏病、重症肌无力、亚急性甲状腺炎等自身免疫病的思路及代表方剂。第九部分是病毒感染的，讲述了伏邪理论应用等疾病的思路以及代表方剂。第十部分是细菌感染的，讲述了慢性感染与伏邪的关系。很后一部分是的，讲述了从伏邪的方法。
该书分为十一部分。部分是伏邪概论，介绍了伏邪的特征、伏邪分类、伏邪病种、伏邪复发以及学习伏邪学说的意义。第二部分是伏邪病机，分别讲述了感而不发、邪伏不争、少阴虚寒、厥阴入络、伏邪成巢、伏邪成劳这六个基本病机。第三部分是伏邪诊断，从伏邪脉法、伏邪的特殊症状等方面，介绍了伏邪的特色诊断方法。第四部分是伏邪治法，讲述了伏邪治疗的五个基本原则等。第五部分是伏邪用药，讲述了治疗伏邪常用的特殊药物等。第六部分是伏邪用方，讲述了治疗伏邪的主方等方剂的制方特色及临床应用。第七部分是伏邪验方，讲述了吴门伏邪验方的制方原理及临床主治等。第八部分是自身免疫病的治疗，讲述了自身免疫病的特征、如何从伏邪看自身免疫病，以及用伏邪理论指导治疗干燥综合征、荨麻疹、强直性脊柱炎、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、复发性口疮、白塞氏病、重症肌无力、亚急性甲状腺炎等自身免疫病的思路及代表方剂。第九部分是病毒感染的治疗，讲述了伏邪理论应用等疾病的思路以及代表方剂。第十部分是细菌感染的治疗，讲述了慢性感染与伏邪的关系。很后一部分是肿瘤的治疗，讲述了从伏邪治疗肿瘤的方法。
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