对传统思想尤其是儒家思想正本清源的分析梳理为“元”，通时达变、联系时代问题为“亨”；鲁迅说内弗失固有之血脉为“元”，外不落后世界之思潮为“亨”，故本书所论可称为“元亨论”。
全书可分为三个部分：
靠前是基础篇，澄清诸多对儒家思想的扭曲丑化，解答儒家究竟是什么，揭示了儒家体系固有的锋芒锐气。指出儒家核心理念不是压制，而是张扬人的个性；不是保守僵化，而是推动变易革新。并在此基础上，通过透彻解析《庄子》内七篇之思想主旨，揭示庄子思想和儒家理念之内在联系。庄子思想实为儒家思想精髓要害所在，庄子可与孟子并列为战国儒家之双翼。
第二是深入篇，分为性论、由论、人的进步论，涉及儒家体系里一些很为深刻，也历来较难理解的概念思想。无此，对儒家之理解，只能停留在皮毛。性论之实质是发现体认自我，明白我之所以为我；由论之实质是社会进步非改造人，而是激发每个人的自我；人的进步论是如何从社会的层面帮助人们实现、弘扬自我（简短概括，可以说性论是体认自我，由论是激发自我，人的进步论是实现自我）。
第三是时代篇，以儒家核心理念应用于当今之时代。通过交易、交易成本等概念的分析和推广，引入交易纯粹度、交易控制度的概念，打破经济问题上的一些成见。指明儒家体系在解决当今一些弊端问题上所具有的潜力，在推动现代社会进步方面所可能发挥的作用。
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