憨山大师注《道德经》，始于万历二十年（1592年），卒于万历三十四年（1606年），前后用功十年，“或经旬而得一语，或经年而得一章”，“每参究透澈，方落笔，苟有一字有疑而不通者，决不轻放”。实为学佛、学老者苦心而注，以期学佛者通达老子，“善自他宗”；学老者破除己见，“得离言之旨”。
憨山大师注《庄子内篇》，创意于约万历十六年（1588年），很终克成于万历四十八年（1620年），前后长达三十二年之久，堪称憨山后半生倾注心血的精心之作。大师自言：“庄子一书，乃老子之注疏。予尝谓老子之有庄，如孔之有孟。若悟彻老子之道，后观此书，全从彼中变化出来。”
蕅益大师于清顺治四年（1647年），年四十九岁，述《四书蕅益解》。解《论语》曰“点睛”，开出世光明也；解《庸》《学》曰“直指”，谈不二心源也；解《孟子》曰“择乳”，饮其醇而存其水也。惜《孟子择乳》失传。
蕅益大师于明崇祯十四年（1641年），年四十三岁，始述《周易禅解》；清顺治二年（1645年），年四十七岁，撰《周易禅解》竟。大师自言：“吾所由解《易》者，无他，以禅入儒，务诱儒以知禅耳。”
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