进化论在同一时期也被作为欧美先进思想的代表介绍到日本，其影响波及到明治思想界的各个领域，并在一段相当长的时间内为日本构建近代化国家提供了理论依据。本文以思想史的研究方法为基础，综合运用政治学、历史学、社会学等诸学科的研究方法，围绕进化论思想在日本的传入、与日本各种思潮的冲突与交融等问题，将采取多视角接近，全方位考察，分主题探讨，以达综合把握的目的。为此，主要选取启蒙思想、国家主义思想、自由民权思想、宗教、社会主义思想这五种明治时期的主流思潮与进化论的关系，分章节探讨相关思潮的思想家们对进化论的认识和评价。此外，还将视角转向同时代的清末中国，以“清末中国留日学人的进化论认识”为主题，通过对清末中国知识分子（严复、康有为、梁启超、孙中山、章炳麟），特别是留日知识分子进化论认识的解读，从更广的视域探讨明治时期日本进化论思想展开的一些基本特点。
发端于欧洲的进化论思想对自然科学研究、人文、社会科学研究领域都产生了广泛而深远的影响。进化论在1877年由美国人莫斯传入日本后，在思想界引起了巨大反响，同时也成为贯穿明治时期日本思想界的一条重要的思想主线。它被作为可以对人类和社会的发展进行解释的重要社会理论，为明治时期的日本知识界提供了新的认识理论和方法论依据。日本的启蒙思想家、国家主义者、自由民权家、宗教家、社会主义者等明治时期不同思想流派的思想家们纷纷学习和探讨进化论，或赞颂，或批判，或利用，或盲从，众说纷纭，莫衷一是。可以说，在明治时期出现的各种思潮基本都与进化论有或多或少的关联，因此研究明治时期日本的进化论思想对于深入探讨和较准确地把握明治思想史的基本特征以及日本近现代思想史的基本走向具有重要的学术价值和现实意义。
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