基于湛若水的上述重要性，历来的中国哲学史著作对其人其学多有讨论， 譬如湛若水与陈献章、的学术异同问题，湛若水自身的思想演变历程等，均为学者们再三致意的重要问题，但迄今仍然聚讼纷纭。主要原因在于，现存湛若水著作有数百卷之巨，版本系统较为复杂，重要刻本分藏海峡两岸，造成相关文献整理出版的严重滞后。本次整理工作在细致全面的版本调查基础上利用了湛若水著作的所有现存版本（比如仅藏于台湾地区的嘉靖十五年刻、万历二十一年修补本《泉翁大全集》八十五卷，是收罗很全的一种湛若水文集版本，而大陆学者之前难以利用），择优确定底本校本，加以校勘、标点，无疑将为学者们提供一部完整而精善的湛若水著作集成。
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