本书收录分散在世界各地公私收藏机构的吐鲁番出土文献残卷汇为一编，包括德国国家图书馆、德国国家博物馆分馆印度艺术博物馆（今与东亚博物馆合并）、俄罗斯科学院圣彼得堡东方学研究所、美国普林斯顿大学葛斯德图书馆、日本东京书道博物馆、东京国立博物馆、大阪四天王寺出口常顺氏、中国国家博物馆、北京大学图书馆、中国科学院图书馆、上海博物馆、辽宁省档案馆等散藏的非佛教文献，与本书所收文书可以直接缀合的大谷文书也予收录。本书共收录363件文书（属同一写本的若干残片计一件），分为上下编。上编为“典籍”，按中国传统的经史子集四部分类编排，并考虑到吐鲁番文书的特殊性，经部下单列小学类，道教文献、摩尼教文献、佛教写经题记三类也归入典籍。下编为“文书”，按年代排序，收入所有公私文书。每件文书，参考前人成果拟题，并做解题、校录、标点等工作，以期提供给学术界可靠的文本。本书还附有部分表示缀合情况和获得版权的新旧照片，共计六十余幅。书后有本书所收文书的按编号排序的索引。
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