经过几个世纪。在联合国星际指挥部全力推动移民计划下，数以百万计的人移民外太空。2525年，一个殖民地丰饶星的联系忽然中断，派往调查的舰队接触了“星盟”（圣约人）这个外星文明。星盟先知宣称，人类亵渎了他们的神，因此要对人类发动血腥圣战。
人类的军事力量完全无法与圣约人抗衡，殖民地接连被摧毁。
为了引开敌人，人类战舰秋之柱载着最后一个斯巴达战士约翰117（士官长）到达一个陌生的星系，在这里，他们发现了环状天体“光晕”。经过不懈战斗，士官长发现这个光晕是星盟祖先留下的禁锢“生命公敌”虫族——洪魔的天体。
士官长不得不引爆了光晕，在摧毁一批进攻地球的敌舰队后九死一生回到了地球。但星盟战舰尾随而至，进攻地球。
士官长为了地球与战友孤军深入敌阵，欲擒拿敌人高官，但他没想到，这是一个巨大的圈套...
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